芦花鸡HDAC9基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织表达分析  

作　　者：李欣 石一鸣[1] 于永生[1] 柳俭强 张琪[1] 李文峰 吴伟东 张立春[1] 赵中利[1] 

机构地区：[1]吉林省农业科学院,吉林长春130033 [2]吉林省农安县畜牧总站,吉林农安130200 [3]吉林省长春市朝阳坡站综合服务中心,吉林长春130000

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第1期158-163,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：吉林省农业科学院基本科研经费项目(KYJF2021ZR007);吉林省科技厅重点研发项目(20210202028NC)。

摘　　要：为探索组蛋白去乙酰化酶9(Histone Deacetylase 9,HDAC9)基因的功能,明确其在芦花鸡不同组织中的表达差异,实验采集芦花鸡各组织,克隆获得HDAC9基因完整CDS区,进行生物信息学分析及组织表达分析。结果显示,芦花鸡HDAC9基因CDS区长度为3 210 bp,编码1 069个氨基酸;芦花鸡HDAC9基因氨基酸序列与號鹦鹉、绿头鸭及雉鸡位于一个分支,同源性较高,亲缘关系较近。HDAC9蛋白分子质量约为118.0 ku,分子式为C_(5145)H_(8261)N_(1499)O_(1613)S_(33),理论等电点为6.33,半衰期为30 h,HDAC9蛋白为水溶性蛋白;HDAC9蛋白存在信号肽,为分泌蛋白;共存在67个潜在的磷酸化位点;存在3个N-糖基化潜在位点。HDAC9蛋白二级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成,三级结构预测结果与其一致。实时荧光定量PCR结果显示,HDAC9基因在芦花鸡不同组织中表达水平存在显著差异,其中在胸肌中表达量最高,其次为睾丸。本实验结果为进一步探索HDAC9基因生物学功能奠定基础。

关 键 词：芦花鸡 HDAC9 克隆 表达差异 生物信息学 

分 类 号：S823.2[农业科学—畜牧学]