广灵大尾羊HSD17B12基因克隆、生物信息学分析及表达规律的研究  

作　　者：车雨彤 张锦美 侯文欣 赵祥[1] 秦朋云 乔利英[1] 刘文忠[1] 刘建华[1] 

机构地区：[1]山西农业大学动物科学学院,山西太谷030801 [2]内蒙古乌兰察布市动物疫病预防控制中心,内蒙古乌兰察布012000

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第3期102-110,共9页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：山西省基础研究计划(202103021224134);山西农业大学科技创新基金项目(2020YZ01)。

摘　　要：本研究旨在克隆广灵大尾羊HSD17B12基因CDS,预测HSD17B12蛋白及其基因启动子区的结构和功能特性,探究HSD17B12基因在前体脂肪细胞分化过程中的表达。采用PCR法克隆HSD17B12基因CDS全长序列;生物信息学软件分析HSD17B12蛋白的理化性质、结构、功能位点和结构域,并进行亚细胞定位、序列相似性分析及其基因核心启动子区和转录因子潜在结合位点的预测;采用实时荧光定量PCR检测HSD17B12基因以及部分转录因子在前体脂肪细胞分化过程中的相对表达量。结果显示,广灵大尾羊HSD17B12基因CDS全长939bp,编码312个氨基酸;HSD17B12蛋白主要定位于内质网,有3个跨膜结构域和33个磷酸位点,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,其氨基酸序列与山羊相似性最高;HSD17B12基因有5个潜在的核心启动子区,存在SP1、ATF2和CREB1等10个转录因子的结合位点;在前体脂肪细胞分化过程中,SP1、ATF2和HSD17B12基因的mRNA表达均呈上升趋势,说明ATF2和SP1可能正向调控HSD17B12基因的表达,促进脂质沉积。本研究为进一步揭示HSD17B12基因在绵羊成脂分化过程中的调控机制奠定了基础。

关 键 词：广灵大尾羊 HSD17B12 克隆 生物信息学分析 前体脂肪细胞 转录因子 

分 类 号：S826.2[农业科学—畜牧学]