不同胎次娟姗牛后肠道微生物组成差异分析  

作　　者：李峰洁 王磊 张海亮 王凯 胡丽蓉 刘登科 刘廷玉[4] 郭刚 黄锡霞[1] 蒋桂娥[4] 王雅春 

机构地区：[1]新疆农业大学动物科学学院,新疆乌鲁木齐830052 [2]中国农业大学动物科学技术学院,农业农村部动物遗传育种与繁殖(家畜)重点实验室,畜禽育种国家工程实验室,北京100193 [3]北京首农畜牧发展有限公司,北京100176 [4]河北省畜牧良种工作站,河北石家庄050061

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第3期168-174,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：河北省重点研发计划项目(20326303D);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-36);长江学者和创新团队发展计划(IRT_15R62)。

摘　　要：为探究胎次对娟姗牛后肠道微生物组成和多样性的影响,寻找与胎次相关的后肠道微生物,实验挑选处于相同饲养管理和日粮条件下,泌乳天数相近的娟姗牛119头,其中1胎牛77头、2胎牛14头、3胎牛28头,采集奶牛的新鲜粪便样品,采用16S rRNA基因测序技术测定奶牛后肠道微生物组成,并分析微生物α多样性、β多样性和LEfSe(Linear Discriminant Analysis Effect Size),统计ASV(Amplicon Sequence Variants)在门和属水平上序列信息及计算相对丰度。α多样性分析结果显示,3胎牛物种的Observedspecies指数、Shannon指数和Chao1指数低于1胎、2胎牛(P<0.05);在Simpson指数中,2胎牛最高,3胎牛最低,但3个胎次间无显著差异;β多样性分析结果显示,不同胎次的肠道菌群结构存在差异(R=0.1599,P=0.001);在门水平上,2胎牛厚壁菌门相对丰度低于3胎牛低于1胎牛,2胎牛拟杆菌门的相对丰度均高于3胎和1胎牛,2胎牛的螺旋体门的相对丰度高于1胎牛高于3胎牛,1胎牛放线菌门的相对丰度高于3胎牛(P<0.05);在属水平上,1胎牛瘤胃球菌属UCG-005的相对丰度高于3胎牛(P<0.05)。此外,LEfSe分析显示1胎牛较其他胎次牛相比存在5个差异微生物,3胎牛较其他胎次牛相比存在8个差异微生物。可见,不同胎次娟姗牛后肠道微生物在结构和组成上相对稳定但存在差异,2胎牛的后肠道微生物多样性最丰富。

关 键 词：娟姗牛 胎次 肠道微生物 粪样 

分 类 号：S823.2[农业科学—畜牧学]