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机构地区:[1]赣南医学院,赣州341000 [2]江苏省肿瘤医院,江苏省肿瘤防治研究所,南京医科大学附属肿瘤医院药学部,南京210009 [3]赣南医学院第一附属医院精准医学中心,赣州341000
出 处:《江西医药》2023年第3期281-284,共4页Jiangxi Medical Journal
基 金:江西省卫生健康委科技计划项目,编号20204495;赣南医学院校级重点项目,编号ZD201908。
摘 要:目的分析螨虫过敏原Der f 22的氨基酸序列特性与二级结构,构建其三维结构模型并基于此对其B、T细胞表位进行预测与分析。方法通过ProtParam对Der f 22的理化性质进行计算。根据其理化性质与氨基酸序列,使用AlphaFold 2和GalaxyRefined2构建并优化Der f 22过敏原的三维结构,进一步利用DNAStar、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTope 2.0和TepiTool预测Der f 22的B细胞表位和T细胞表位。结果基于氨基酸序列,我们得到了Der f 22蛋白的二级结构特征与三维结构。利用多种生物信息学工具,我们预测并筛选出6个线性B细胞表位、19个参与形成构象B细胞表位的关键残基和4个T细胞表位。结论本研究得到的蛋白质结构和抗原表位为进一步对Der f 22功能改造及低免疫原性疫苗的开发奠定基础。
关 键 词:过敏性疾病 螨虫 生物信息学 B细胞表位 T细胞表位
分 类 号:R384.4[医药卫生—医学寄生虫学]
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