贵州白山羊PRDM16基因表达及多态性与生长性状关联分析  

作　　者：陈敏 黄琴 杨驰 黄明捷 宋兴超 安清明 

机构地区：[1]黔东南苗族侗族自治州畜牧技术推广站,贵州凯里556000 [2]铜仁学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室/农林工程与规划学院,贵州铜仁554300

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第6期151-156,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2020]1Y029);贵州省高层次创新型人才培养项目(2022[2020]037);贵州省重点实验室项目(黔科合平台人才[2020]2003);贵州省铜仁市科学技术局博士人才项目(铜市科研(2020)126号);铜仁市科技局科技支撑计划项目(铜市科研[2020]128);大学生创新创业计划项目(S202110665014)。

摘　　要：为了分析贵州白山羊PRDM16(Positive Regulatory Domain Containing 16,PRDM16)基因表达水平及核苷酸变异位点(SNPs)与生长性状的关联性,本研究利用混合池测序筛选PRDM16基因变异位点,采用PopGene 32.0软件计算等位基因频率、基因型频率、遗传纯合度(Ho)、遗传杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)和Hardy-Weinberg平衡状态;应用PIC软件计算多态性信息含量(PIC),应用RT-PCR检测PRDM16基因在不同性别白山羊背最长肌中表达水平;应用MINTAB软件分析核苷酸变异与生长性状的关联性。结果表明,贵州白山羊PRDM16基因P2区存在1个核苷酸变异位点g.342 A/G,且该位点的Ho高于He,PIC检测为中度多态,偏离Hardy-Weinberg平衡状态。RT-PCR结果表明,PRDM16基因mRNA在母羊背最长肌中的表达水平显著高于公羊。关联分析表明,贵州白山羊PRDM16基因g.342 A/G位点变异与胸围显著相关,存在等位基因A的群体具有更高的胸围指标,且等位基因间存在协同效应,杂合型群体AG较纯合型群体具有更高的胸围指标。贵州白山羊PRDM16基因可作为培育贵州白山羊优良品系的候选基因标记。

关 键 词：贵州白山羊 PRDM16基因 基因表达 生长性状 关联分析 

分 类 号：S827.2[农业科学—畜牧学]