荧光PCR熔解曲线法快速鉴定痰标本中分枝杆菌菌种的临床应用价值  

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作  者:陈新朝 陈晓红 许榕青 黄明翔 

机构地区:[1]福州肺科医院,福建福州350008

出  处:《深圳中西医结合杂志》2023年第8期54-57,共4页Shenzhen Journal of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine

基  金:福建省福州市科技计划项目(2021-S-194)。

摘  要:目的:研究荧光聚合酶链式反应(PCR)熔解曲线法快速鉴定痰标本中分枝杆菌菌种的临床应用价值。方法:采集福州肺科医院2018年1月至2019年12月经BACTEC MGIT 960系统液体培养阳性的558株疑似非结核分枝杆菌(NTM)临床分离菌株。对所有菌株均开展荧光PCR熔解曲线及16S核糖体核糖核酸(rRNA)基因测序法鉴定。将16S rRNA基因测序结果作为标准,采用荧光PCR熔解曲线法鉴定NTM的效能,分析主要NTM的耐药性情况。结果:16S rRNA基因测序法鉴定结果显示,疑似NTM菌种以胞内分枝杆菌(M.胞内)、龟/脓肿分枝杆菌(M.龟/脓肿)、鸟分枝杆菌(M.鸟)、堪萨斯分枝杆菌(M.堪萨斯)及戈登分枝杆菌(M.戈登)为主;荧光PCR熔解曲线法鉴定结果显示,疑似NTM菌种亦以上述5种为主。荧光PCR熔解曲线法鉴定M.龟/脓肿的灵敏度、特异度及准确度为95.7%、100.0%、99.1%;M.胞内的灵敏度、特异度及准确度为100.0%、97.3%、98.7%;M.鸟灵敏度、特异度及准确度为88.7%、100.0%、98.6%;其他NTM菌种的灵敏度、特异度及准确度均为100.0%。一致性分析结果显示:荧光PCR熔解曲线法与基因测序法鉴定各种NTM菌种的一致性在0.81~1.00之间。16S rRNA基因测序法与荧光PCR熔解曲线法鉴定结果不一致菌株共13株,包括5株M.龟/脓肿及8株M.鸟。结论:荧光PCR熔解曲线法快速鉴定痰标本中NTM菌种的效能较佳,与基因测序法存在较高的一致性。

关 键 词:非结核分枝杆菌 聚合酶链式反应 熔解曲线法 

分 类 号:R521[医药卫生—内科学] R378.911[医药卫生—临床医学]

 

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