甘蓝型油菜BnaC.RECQ4B基因的生物信息学与组织表达分析  

Bioinformatics and tissue expression analysis of BnaC.RECQ4B gene in Brassica napus

作　　者：丁鹏 高月 谭小力[1] 朱克明[1] Ding Peng

机构地区：[1]江苏大学生命科学学院,江苏镇江212013

出　　处：《江苏农业科学》2023年第12期57-64,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金面上项目(编号:31671720)。

摘　　要：RECQ解旋酶是机体分子代谢途径中重要的调控蛋白,本研究为了探究甘蓝型油菜减数分裂中解旋酶RECQ的功能及其表达模式。首先,运用RT-PCR技术克隆获得1个甘蓝型油菜RECQ基因,并命名为BnaC.RECQ4B,运用PCR技术克隆获得BnaC.RECQ4B的启动子序列,命名为Pro.BnaC.RECQ4B;并对该基因编码的蛋白以及启动子序列进行生物信息学分析;最后,运用qRT-PCR技术对甘蓝型油菜不同组织进行基因表达量分析。结果表明,BnaC.RECQ4B开放阅读框(ORF)长度为3477 bp,编码1158个氨基酸,分子质量为18086 u,等电点为8.38,属于亲水性不稳定碱性蛋白,可能是非分泌蛋白,蛋白质二级和三级结构显示无规则卷曲和α-螺旋所占比例较高,BnaC.RECQ4B与拟南芥的氨基酸序列相似性达到74%,该基因启动子不仅包含多种响应逆境胁迫的顺式元件,还包含大量的光反应与光响应相关调控元件,BnaC.RECQ4B在花苞、花中表达量较高,分别是根中的11.94、11.19倍;在叶、茎、角果中也有较高表达,分别是根中的10.50、4.73、5.93倍。上述结果初步表明,BnaC.RECQ4B具有解旋酶功能,可能参与植物体的DNA损伤修复等功能,为进一步探讨甘蓝型油菜BnaC.RECQ4B基因表达调控及作用机制提供了理论支持与实践基础。

关 键 词：甘蓝型油菜 RECQ解旋酶 生物信息学 克隆 基因表达量 

分 类 号：S634.301[农业科学—蔬菜学]