广西巴马小型猪NLRP6基因的克隆、生物信息学及组织表达分析  

作　　者：江山 张帅 张坤 许迪 颜港 邢天琦 王钰滨 王梦影 兰干球[1] 梁晶[1] 

机构地区：[1]广西大学动物科学技术学院,广西南宁530004

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第8期106-111,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：现代农业广西创新团队生猪首席专家(C3340051510);广西创新驱动发展专项(桂科AA17204029);广西科技重大专项(桂科AA17292002)。

摘　　要：为探究NLR Family Pyrin Domain Containing 6(NLRP6)在广西巴马小型猪的蛋白结构和组织表达水平,本实验以巴马小型猪为材料,通过克隆获取了NLRP6的CDS序列全长,并进行生物信息学和组织表达谱分析,同时采用qRT-PCR分析NLRP6基因在不同组织的表达分布情况。结果显示,NLRP6基因的CDS序列全长为2640 bp,编码879个氨基酸。生物信息学分析表明,NLRP6蛋白分子式预测为C_(4294)H_(6958)N_(1234)O_(1272)S_(37),等电点为8.12,为亲水性碱性蛋白质。经氨基酸序列比对和物种进化树分析发现,广西巴马小型猪NLRP6基因与猪的遗传距离最近,其次是牛,与小鼠的遗传距离最远。qRT-PCR结果表明,NLRP6基因在肾脏组织表达最高,同时在小肠部位具有很高的表达水平,但在心脏和肌肉组织中表达量极低。本研究结果为进一步研究猪NLRP6基因提供了理论参考。

关 键 词：NLRP6基因 抗菌功能 肠道 

分 类 号：S828[农业科学—畜牧学]