香猪皮肤转录组衰老相关病毒源基因的筛选和鉴定  

作　　者：张红辉 黄世会 牛熙[2] 李升[2] 冉雪琴[1] 王嘉福[2] 

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 [2]贵州大学农业生物工程研究院,贵州贵阳550025

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第8期228-236,共9页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家自然科学基金(31960641);贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615);贵州省“百”层次创新型人才培养项目(黔科合人才[2016]4012号)。

摘　　要：皮肤是哺乳动物抵御致病因素的第1道防线,在皮肤衰老的过程中,整合到哺乳动物基因组中的病毒源基因序列会被重新激活,影响宿主基因的表达,激起细胞对病毒的反应,引起慢性炎症、促进细胞衰老。本研究旨在探究病毒源基因表达与皱皮香猪皮肤皱纹形成的关系,选取12~18月龄皱皮香猪和普通香猪各5头进行转录组测序和生物信息学分析,采用RT-qPCR方法对皱皮香猪中差异表达的病毒源基因进行验证。2组中皮肤组织差异表达基因与病毒整合位点数据库进行比对分析,筛选出612个差异表达的病毒源基因。以普通香猪为对照,得到上调基因182个,下调基因430个,这些差异表达的病毒源基因主要富集在皮肤发育、炎症反应等GO条目,以及长寿调控途径、FoxO信号通路、细胞衰老等KEGG通路。经猪-人同源基因转换,与免疫、衰老、人类皮肤相关的基因取交集,筛选出高表达的候选基因6个:AGT、CAT、CTNNB1、JUP、KRT75和LIPE,采用RT-qPCR验证了皮肤中这6个基因的差异表达,与转录组测序结果趋势一致。研究结果表明,皱皮香猪皮肤皱纹的形成与病毒源基因的异常表达有紧密联系,本研究可为后期皱皮香猪皮肤褶皱形成的分子机制及衰老分子标记物选择奠定理论基础。

关 键 词：香猪 褶皱 衰老 病毒源基因 差异表达基因 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]