基于SNP芯片对陆川猪进行遗传多样性与遗传结构分析的研究  

作　　者：周隽 覃星文 吴细波 覃燕灵 吴先华 肖有恩 张宁 韦明宇 司景磊 

机构地区：[1]广西农垦永新畜牧集团有限公司良圻原种猪场,广西南宁530317 [2]广西农垦永新畜牧集团新兴有限公司,广西柳州545025 [3]广西农垦永新畜牧集团有限公司,广西南宁530012 [4]广西农垦永新畜牧集团牧业科技有限公司,广西南宁530022 [5]广西大学动物科学技术学院,广西南宁530003

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第8期257-263,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：财政部和农业农村部:国家生猪产业技术体系(CARS-35);广西良圻农场农业科技园区创新辐射能力建设(桂科AD22035976);国家现代农业产业技术体系广西创新团队(nycytxgxcxtd-15-01)。

摘　　要：陆川猪是我国优良的地方品种,但由于非洲猪瘟的影响导致其养殖量急剧下降,对其进行种质资源保护刻不容缓。本研究旨在通过SNP芯片分析陆川猪遗传结构和遗传多样性,为该群体后续保种策略提供一定的参考。本研究基于269头能繁公母猪SNP芯片信息,分析该群体遗传结构、亲缘关系、家系划分以及近交系数。结果显示,该群体部分个体遗传关系较近,IBS遗传距离在0.09~0.31,平均值为0.25;通过聚类分析和G矩阵结果,将269头陆川猪分为3个家系,分别有9、3、6头公猪,母猪在家系间存在交叉;ROH分析发现该群体平均ROH长度为(503.77±8.89)Mb,主要分布在388~475 Mb,FROH主要分布在0.13~0.23,其平均FROH为0.21±0.004。研究表明,该群体陆川猪家系较少,ROH数量多且较长,近交风险较大,急需引入外源血统丰富其遗传多样性,并根据芯片结果,合理规划配种策略,降低群体近交水平。

关 键 词：陆川猪 SNP芯片 遗传结构 近交系数 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]