基于生物信息学方法研究IgA肾病患者肾组织的核心基因及免疫微环境  被引量:3

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作  者:白雅雯[1] 李雅静[1] 席亚莉 麻春杰[1] 

机构地区:[1]内蒙古医科大学,呼和浩特010110

出  处:《中国中西医结合肾病杂志》2023年第7期605-607,I0003,共4页Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Nephrology

基  金:内蒙古自治区研究生科研创新项目(No.B20210193Z);内蒙古自治区自然科学基金面上项目(No.2019MS08008);内蒙古医科大学科技百万工程项目(No.YKD2018KJBW021);内蒙古自治区自然科学基金联合项目(No.2023LHMS08075)。

摘  要:目的:通过生物信息学方法分析IgA肾病患者肾组织的核心基因和免疫细胞浸润特点,探索IgA肾病的发病机制。方法:从GEO数据库下载GSE104948、GSE104954、GSE37460和GSE35487的基因表达矩阵,运用R语言筛选差异表达基因,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络,并计算核心基因。运用CIBERSORTx数据库分析不同组别的免疫细胞浸润特点。结果:共获得218个差异表达基因,筛选出22个核心基因,如C1QA、C1QB、CD48、CD53、CSF1R等。与正常组相比,IgA肾病患者肾组织中初始B细胞、记忆CD+4T细胞、树突状细胞、活化肥大细胞和中性粒细胞水平降低;M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞和M2型巨噬细胞、NK细胞、单核细胞、静息肥大细胞水平增高。结论:IgA肾病肾组织免疫细胞以巨噬细胞浸润为主要特点,其核心基因主要与炎性反应和免疫调节紊乱有关。

关 键 词:IGA肾病 生物信息学 核心基因 免疫微环境 

分 类 号:R692.31[医药卫生—泌尿科学] Q811.4[医药卫生—外科学]

 

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