山羊TSPAN6基因克隆及序列分析  

作　　者：陈欣欣 崔羽茜 王宁[1] 任玉鹏 张焕容[1] 杨发龙[1] 朱江江 向华 

机构地区：[1]西南民族大学畜牧兽医学院,四川成都610041 [2]青藏高原动物遗传资源保护与利用,四川省重点实验室,四川成都610041

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第10期133-139,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：四川省自然科学基金项目(2022NSFC0082);四川省重点研发项目(2021YFN0008);四川省畜禽育种攻关项目(2021YFYZ0003);浙江省科技计划项目(2022C04017)。

摘　　要：TSPAN6是四跨膜蛋白超家族成员之一,与病毒毒力、致病性及肿瘤发生相关。本研究旨在克隆山羊TSPAN6基因序列并进行生物信息学分析。以简州大耳羊为实验对象,无菌采集其肝脏,Trizol法提取组织总RNA,并反转录为cDNA,RT-PCR技术克隆山羊TSPAN6基因序列,利用在线软件进行生物信息学分析。结果显示,成功克隆得到TSPAN6基因,共1 400 bp(GenBank登录号:ON337134),包括5’UTR 149 bp,CDS区长738bp,3’UTR23bp,编码245个氨基酸残基。山羊TSPAN6基因序列与绵羊、牛、猪、斑马、海豹和狐狸的相似性分别达到99.32%、98.24%、93.63%、93.90%、92.41%和92.68%。TSPAN6蛋白分子式为C1259H1952N310O346S18,分子质量为27 544.30 Da,是1种偏碱性、稳定的疏水性蛋白。TSPAN6蛋白无信号肽,存在4个跨膜结构域,二级结构显示以α螺旋为主,无β折叠结构,含有1个N糖基化位点与41个磷酸化位点。亚细胞定位预测TSPAN6蛋白主要定位于细胞膜,可能与MAVS、ZFHX4、SEZ6L2等10个蛋白存在相互作用。本实验成功克隆了山羊TSPAN6基因,为后续山羊TSPAN6基因功能的研究提供了参考依据。

关 键 词：山羊 TSPAN6基因 基因克隆 生物信息学分析 

分 类 号：S827.2[农业科学—畜牧学]