板蓝与葡萄、漾濞槭基因组的共线性分析  

Collinearity analysis of the genomes of Isatis,Grape,and Acer yangbiense

作　　者：肖启蒙 XIAO Qimeng

机构地区：[1]华北理工大学生命科学学院,河北唐山063210

出　　处：《南方农业》2023年第15期12-15,F0003,共5页South China Agriculture

摘　　要：板蓝(Strobilanthes cusia)具有极高的药用价值,全草可入药,是中草药南板蓝根的主要成分。为了厘清板蓝基因组的进化历程,探究板蓝的生物学功能,通过将板蓝基因组与葡萄(Vitis vinifera)、漾濞槭(Acer yangbiense)基因组进行全基因组比对,采用推断基因组同源性、同义碱基替换、Ks的核函数分析、鉴定染色体的直系和旁系同源区域、全基因组与局部比对等方法,发现板蓝在经历了核心真双子叶共享的三倍化事件后,还额外经历了一次三倍化事件,并且确定时间节点在106~120个百万年前。

关 键 词：板蓝 共线性 多倍化 全基因组比对 同义核苷酸替换率 

分 类 号：S567.239[农业科学—中草药栽培]