基于生物信息学分析PRDM家族在甲状腺癌中的表达及临床意义  

Analysis of the expression and clinical significance of PRDM family in thyroid carcinoma based on bioinformatics

作　　者：李娜 曹状 程显斌 向新 胡雪 王思佳 LI Na;CAO Zhuang;CHENG Xian-Bin

机构地区：[1]吉林省医疗急救指挥中心,吉林长春130021 [2]吉林大学第二医院甲状腺外科 [3]吉林大学中日联谊医院胃肠结直肠外科 [4]吉林大学中日联谊医院乳腺外科 [5]吉林省人民医院烧伤整形外科

出　　处：《中国老年学杂志》2024年第1期15-21,共7页Chinese Journal of Gerontology

基　　金：吉林省卫生健康科技能力提升项目(2022JC020);吉林省科技发展计划项目重点研发项目(20210203059SF)。

摘　　要：目的探讨PRD-BF1和RIZ同源结构域蛋白(PRDM)家族在甲状腺癌中的表达及与甲状腺癌患者预后的关系,对部分家族成员在甲状腺癌中的作用机制进行初步分析。方法运用UALCAN数据库分析PRDM家族在甲状腺癌中的表达;UALCAN数据库分析PRDM家族与甲状腺癌预后的关系;StarBase和HMDD数据库分析与PRDM家族成员相互作用的上游miRNA;StarBase数据库分析与PRDM家族成员相互作用的下游靶基因;DAVID数据库对PRDM家族成员相互作用的下游靶基因进行生物学功能注释。结果PRDM1、PRDM3在甲状腺癌组织中表达水平明显高于正常组织(P<0.05)。PRDM2、PRDM4、PRDM5、PRDM6、PRDM8、PRDM10、PRDM11、PRDM15、PRDM16在甲状腺癌组织中表达水平明显低于正常组织(P<0.05)。PRDM6、PRDM11、PRDM12、PRDM16与甲状腺癌的患者预后高度相关(P<0.05)。在甲状腺癌中与PRDM6相关并具有统计学意义的miRNA为hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-625-5p(P<0.05)。对与PRDM6相关的下游靶基因预测并进行生物学功能注释,PRDM6可通过与靶基因的作用参与DNA损伤修复等生物学过程。结论PRDM家族的表达与甲状腺癌相关,部分家族成员的表达与甲状腺癌预后及临床病理特征密切相关。PRDM家族成员PRDM6可通过与上游miRNA及下游靶基因的相互作用,参与甲状腺癌的发生发展。PRDM家族,特别是PRDM6,可能成为甲状腺癌诊治的新靶点。

关 键 词：PRD-BF1和RIZ同源结构域蛋白(PRDM)家族 生物信息学分析 甲状腺癌 

分 类 号：R65[医药卫生—外科学]