高良姜CCR基因的序列特征和表达模式分析  

作　　者：黄琼林 

机构地区：[1]广东医科大学,广东湛江524023

出　　处：《现代园艺》2024年第3期38-40,44,共4页contemporary horticulture

基　　金：广东省中医药局中医药科研项目(20211224)。

摘　　要：肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是植物苯丙氨酸代谢途径的关键酶,参与调控木质素等次生代谢产物的生物合成。从前期建立的高良姜转录组测序数据中鉴定出高良姜CCR基因的cDNA序列,采用生物信息学方法对其编码蛋白的理化性质、保守功能域、亲/疏水性、跨膜结构域、信号肽、空间结构及系统发育关系等进行分析,并利用实时荧光定量PCR技术检测CCR基因在高良姜不同器官中的相对表达量。结果显示,高良姜CCR基因编码区长度为1 008bp,编码335个氨基酸。该基因的编码蛋白分子量为36.68 k Da,含有一处转运肽,不含信号肽、靶向肽和跨膜结构,具有CCR保守功能域。CCR基因在高良姜叶、茎和根茎中均有表达,其中以在茎中的表达最为显著,其次是根茎,最少是叶片。本研究明确了高良姜CCR酶基因的序列特征和表达模式,为基于CCR基因工程的高良姜木质素生物合成及种质改良奠定了一定基础。

关 键 词：高良姜 肉桂酰辅酶A还原酶 木质素 生物信息学 表达模式 

分 类 号：S567.239[农业科学—中草药栽培]