基于生物信息学分析糖尿病肾病的关键致病基因及靶向中药活性成分的筛选研究  

作　　者：袁心柱 李玲琴[2] 林昌伟[1] 夏梦迪[1] 王宝福[1] 袁祖君 谢席胜[1] 

机构地区：[1]川北医学院附属南充市中心医院肾内科,南充637000 [2]川北医学院附属医院风湿免疫科,南充637000

出　　处：《中国中西医结合肾病杂志》2023年第11期996-999,I0004,I0005,共6页Chinese Journal of Integrated Traditional and Western Nephrology

基　　金：四川省中医药管理局基金资助项目(No.2020JC0079);南充市科技局基金资助项目(No.19SXHZ0141);川北医学院科研基金资助项目(No.CBY21-QA06)。

摘　　要：目的:利用生物信息学方法分析GEO芯片数据,寻找糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的关键基因以及信号通路,挖掘可能作用于靶向基因的中药活性成分。方法:从GEO数据库下载DN基因表达谱芯片数据集GSE142153,使用R软件进行差异基因的筛选,并进行生物学过程、信号通路分析,应用STRING数据库对差异基因进行蛋白质网络分析,利用Cytoscape中的cytohubb插件进行核心基因筛选,通过CTD数据库寻找靶向作用的中药活性成分。结果:筛选出差异基因共计158个。GO富集分析主要富集于对脂多糖的反应、白介素系列等;KEGG主要富集于多个炎症因子、细胞因子-细胞因子受体相互作用等。筛选出IL6、CXCL8、IL1B、MMP9、IL10、CXCL1、EGF、CCL2、CXCL2和CCL20等10个关键致病基因。发现作用于靶向基因的中药活性成分包括白藜芦醇、槲皮素、冬凌草甲素、人参皂苷、大黄素、姜黄素、雷公藤红素、芦丁等。结论:DN的发生与发展涉及多基因多条通路,白介素系列值得关注。白藜芦醇、槲皮素、冬凌草甲素、人参皂苷、大黄素、姜黄素、雷公藤红素、芦丁等可能是潜在靶向作用于DN的中药活性成分。

关 键 词：糖尿病肾病 GEO数据库 生物信息学 

分 类 号：R259[医药卫生—中西医结合] R277.5[医药卫生—中医内科学]