CA-NHEJ系统对大肠杆菌链霉素耐药基因rpsL的编辑效率及其耐药性研究  

Editing efficiency and drug resistance of streptomycin resistant gene rpsL of Escherichia coli by CA-NHEJ system

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作  者:谢钰珍 覃鸿妮[1] 吴凡 胡杨晓然 薛高旭 赵雪 张勇 Xie Yuzhen

机构地区:[1]苏州工业园区服务外包职业学院,江苏苏州215123 [2]苏州工业园区德威联合书院,江苏苏州215123 [3]金唯智生物科技有限公司,江苏苏州215123

出  处:《江苏农业科学》2023年第23期17-21,共5页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:国家自然科学基金面上项目(编号:22077092);江苏省精准诊疗药物创制工程研究中心(苏州大学)开放课题(编号:SDGC2239);2022年江苏省高校“青蓝工程”资助项目。

摘  要:以控制质粒拷贝数的pcnB基因与链霉素耐药性rpsL基因为靶标基因,研究CA-NHEJ系统对大肠杆菌的基因编辑效率,及rpsL相关基因与链霉素耐药性的关系。通过CA-NHEJ系统成功实现了对大肠杆菌MG1655的pcnB和rpsL基因编辑,其中,pcnB基因编辑效率达100%,rpsL基因仅有1个克隆缺失第22~24位3个氨基酸,其他4个克隆未编辑成功但具有链霉素抗性;进一步利用CA-HR系统敲除大肠杆菌MG1655的rpsL基因CCTGCGCTG序列(第22~24位氨基酸),编辑效率达100%,验证了CA-HR的高效性,抗性鉴定表明,该序列是影响链霉素抗性的关键序列,是一个未曾报道的新突变;对于未编辑成功但具有链霉素抗性的4个克隆进行基因测序及比对,找出了rhsC和gadB等6个可能与链霉素抗性相关的其他基因。

关 键 词:CA-NHEJ系统 CA-HR系统 RPSL基因 耐药性 

分 类 号:S188[农业科学—农业基础科学]

 

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