赤水乌骨鸡PTGDS基因克隆、序列特征及组织表达分析  

Cloning,sequence characteristics and tissue expression of PTGDS gene in Chishui black bone chicken

作　　者：吴芸[1] 欧正淼 殴小嫚 陈粉粉 闫吉美[1] 李盼盼 Wu Yun

机构地区：[1]遵义师范学院生物与农业科技学院,贵州遵义563006 [2]西南林业大学生命科学学院,云南昆明650224

出　　处：《江苏农业科学》2023年第23期22-27,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：贵州省教育厅特色领域项目(编号:黔教合KY字[2019]076);遵义师范学院服务地方产业革命项目(编号:遵师合地方产业字[2020]05号);遵义师范学院博士启动基金(编号:遵师BS[2017]15号)。

摘　　要：为研究赤水乌骨鸡PTGDS基因的结构和功能,检测其在赤水乌骨鸡不同组织、胸肌和腿肌中的表达情况,探究PTGDS基因对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR获得PTGDS基因CDS序列,对其氨基酸序列进行生物信息学分析,揭示其结构特征和亲缘关系,同时通过qPCR检测赤水乌骨鸡PTGDS基因在同一时期不同组织中的表达特性。结果显示,赤水乌骨鸡PTGDS基因编码区长558 bp,编码186个氨基酸,保守性分析发现赤水乌骨鸡PTGDS基因与原鸡的同源性最高,核酸和氨基酸序列比对同源性分别为100%;系统进化分析发现,赤水乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近,与黑天鹅和鸿雁的亲缘关系最远。PTGDS基因在各组织中均有表达,在肾中的表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05);肌肉中腿肌的表达量高于胸肌,但差异不显著(P>0.05)。研究结果可为进一步揭示PTGDS基因的功能和调控机制提供参考。

关 键 词：赤水乌骨鸡 PTGDS基因 生物信息学分析 组织mRNA表达 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]