内蒙古地方绵羊遗传多样性及尾椎数性状相关选择信号研究  

作　　者：常晨城 白音巴图 周乐 杨彦达 马凤英 刘在霞 王杰 何小龙 付绍印 张文广[1,2,4] 石彩霞 刘永斌[5] 

机构地区：[1]内蒙古农业大学动物科学学院,内蒙古呼和浩特010018 [2]内蒙古自治区农业基因组大数据工程研究中心,内蒙古呼和浩特010018 [3]内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古呼和浩特010031 [4]内蒙古农业大学生命科学学院,内蒙古呼和浩特010018 [5]内蒙古大学生命科学学院,内蒙古呼和浩特010021

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第12期109-115,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：内蒙古自治区科技重大专项(2020ZD0003);国家重点研发计划(2021YFD1200905);内蒙古自治区科技重大专项(2019ZD016);内蒙古自治区科技计划(2021GG0012);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-38)。

摘　　要：本文旨在通过全基因组重测序技术评价内蒙古地方绵羊遗传多样性,筛选与绵羊尾椎数性状相关的候选基因。利用内蒙古当地2个典型肉羊品种(蒙古羊28只、巴美肉羊21只)进行全基因组重测序,过滤去掉高缺失率以及最小等位基因频率较低的位点,得到高质量SNP;对各品种进行核苷酸多样性(Pi)、群体分化指数(Fst)、Tajima’s D检测以及连锁不平衡衰减分析,评价其遗传多样性;利用2个品种中个体变异位点进行主成分分析、系统进化树分析以及种群结构分析,确定品种间遗传分化水平;采用群体分化指数和核苷酸多样性比值综合筛选确定蒙古羊中与尾椎数性状相关的选择信号。遗传多样性及种群结构分析结果表明,蒙古羊的连锁不平衡衰减速度大于巴美肉羊,当K=2时,2个群体被明显分开,但还存在一定程度的混合,说明蒙古羊较巴美肉羊具有较高的遗传多样性,且2个群体间存在一定程度的遗传背景相似度。通过对巴美肉羊与蒙古羊以及不同尾椎数的蒙古羊的选择信号分析,共筛选出与尾椎数性状相关的候选基因19个,其中HOX基因家族、T-box基因家族、VRTN和BMP2受到强烈选择,可作为后续绵羊尾部性状研究、分子选育的重要线索,同时也为蒙古羊遗传改良及选种选育提供理论依据。

关 键 词：蒙古羊 巴美肉羊 遗传多样性 尾椎数 选择信号 

分 类 号：S826.2[农业科学—畜牧学]