猪PCK1基因SNPs检测及其与生长育肥性状的关联分析  

作　　者：展西振 刘军 彭雅鑫[1,2,3] 秦亮 吕威 阮兴友 左波 

机构地区：[1]华中农业大学动物科技学院,湖北武汉430070 [2]农业农村部猪遗传育种重点实验室,湖北武汉430070 [3]农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北武汉430070 [4]济南市章丘区畜牧兽医事业发展中心,山东济南250200

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第11期106-111,118,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：农业农村部核心攻关项目(NK2022110404);湖北省重大科技专项(2021ABA016);湖北省自然科学基金(2021CFA018)。

摘　　要：本实验旨在研究猪磷酸烯醇丙酮酸羧激酶1(Phosphoenolpyruvate Carboxykinase 1,PCK1)基因SNPs及其与生长育肥性状之间的关系,为猪育种提供新的标记资源。本研究以美系大白猪为研究对象,采用直接测序的方法检测PCK1基因内部的多态性位点,并与生长育肥性状进行关联分析。结果发现在美系大白猪中共检测到PCK1基因11个SNPs,关联分析结果显示,PCK1基因多态性位点rs713611695与初生重、达100 kg体重日龄极显著相关,与眼肌面积显著相关;多态性位点rs324442589与达100 kg体重日龄和体长性状显著相关、与眼肌面积极显著关联;多态性位点rs699149356与活体背膘厚极显著相关;多态性位点rs321585061与初生重极显著关联;多态性位点rs331839879与初生重极显著关联、与左乳头数显著关联;多态性位点rs335103760与初生重和眼肌面积极显著关联;多态性位点rs341303544与初生重极显著关联、与体长显著关联。连锁不平衡分析结果显示,多态性位点rs321585061与rs702046790、rs321585061与rs335103760、rs702046790与rs335103760、rs331839879与rs323291342、rs713611695与rs323291342、rs713611695与rs331839879处于强连锁不平衡(D’>0.8,r^(2)>0.33)。单倍型组合分析发现,单倍型组合H2-H5、H3-H3达100kg体重日龄极显著高于H1-H1、H1-H2、H1-H3、H2-H4;单倍型组合H1-H3、H1-H4、H3-H3活体背膘厚性状极显著高于H3-H4;单倍型组合H2-H5初生重极显著高于H2-H2;单倍型组合H1-H2、H1-H3、H2-H3眼肌面积极显著高于H2-H5;单倍型组合H1-H3体长极显著高于H3-H3,H1-H3是改良猪眼肌面积和体长性状的优势单倍型组合。以上结果表明PCK1基因可以作为猪遗传改良的候选基因,也为深入研究该基因功能提供了一定的参考。

关 键 词：PCK1 猪 SNP 生长育肥 关联分析 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]