猪圆环病毒3型的鉴定和遗传演化分析  

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作  者:陈燕凌 王颖旺 杨潞 杨漫漫 李雪梅[3] 张月 田志革 胡晓亮 

机构地区:[1]四川省宜宾市农业农村局 [2]四川省宜宾市翠屏区农业农村局 [3]宜宾学院农林与食品工程学部,宜宾市动植物检验检疫工程技术研究中心

出  处:《世界热带农业信息》2024年第2期63-65,共3页World Tropical Agriculture Information

基  金:宜宾学院博士启动项目(2019QD09,2019QD10)。

摘  要:为了解宜宾市养殖场猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异规律。本试验利用PCR方法从流产母猪血液中鉴定出1株PCV3,命名为SC-YB2203。经过PCR方法扩增部分基因组序列,对测序结果拼接并进行系统进化树分析。结果显示:遗传进化树分析发现SCYB2203与广州株MK142771和美国株MK496279属于同一分支3f,与西班牙株MH579746和美国株MK496280亲缘关系较近,与四川株MZ449244和重庆株KY075990亲缘关系较远。序列分析发现SC-YB2203与参考序列之间的同源性最高的为重庆株KY075990(98.5%),与湖南株MG372488的同源性为87.7%,与其他国内株同源性较高(97.6%-98.5%)。

关 键 词:遗传变异规律 遗传演化分析 系统进化树分析 PCR方法 基因组特征 序列分析 宜宾市 参考序列 

分 类 号:S85[农业科学—兽医学]

 

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