丹参SmWRKY33基因的克隆与表达分析  

Cloning and expression analysis of SmWRKY33 gene in Salvia miltiorrhiza

作　　者：龚婷 刘灵娣[1] 温春秀[1] 武玉翠 王升 万修福 孙亚倩 姜涛 Gong Ting

机构地区：[1]河北省农林科学院经济作物研究所,河北石家庄050051 [2]河北工程大学园林与生态工程学院,河北邯郸056038 [3]道地药材国家重点实验室,北京100700

出　　处：《江苏农业科学》2024年第3期53-60,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：中央本级重大增减支项目(编号:2060302);国家现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-21);河北省重点研发计划专项(编号:22326301D)。

摘　　要：为了研究WRKY33基因在丹参非生物胁迫中的作用机制,以白花丹参为试验材料,对丹参转录组数据进行分析,挖掘出丹参WRKY33基因参考序列并设计特异性引物,利用基因克隆技术从丹参中克隆出WRKY33基因的全长cDNA,命名为SmWRKY33。对SmWRKY33基因进行生物信息学分析,同时利用荧光定量方法探究SmWRKY33基因在逆境胁迫下的表达模式。结果表明,SmWRKY33基因核苷酸长度为1 635 bp,编码544个氨基酸。生物信息学分析显示,SmWRKY33基因的理论相对分子量为60 835.66,等电点为7.00,定位于细胞核,不存在跨膜区及信号肽,SmWRKY33蛋白为不稳定亲水蛋白。亲缘关系显示,SmWRKY33与紫苏、芝麻、白花泡桐的WRKY33亲缘关系较近。密码子偏好性分析得出拟南芥真核表达最适应丹参SmWRKY33基因的外源表达。qRT-PCR结果表明,SmWRKY33基因在低温、高温、PEG、NaCl等逆境胁迫诱导下具有不同的表达模式,其中低温、NaCl能显著诱导SmWRKY33基因的高表达,说明该基因对温度调节、盐胁迫较为敏感,猜测其参与温度、盐胁迫调控反应机制。本试验首次从丹参中克隆出SmWRKY33基因,探讨了该基因在丹参逆境胁迫下的作用机制,旨在为培育丹参的抗逆新品种提供参考基因。

关 键 词：丹参 SmWRKY33基因 生物信息学 QRT-PCR 基因克隆 

分 类 号：S567.530.1[农业科学—中草药栽培]