gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析  

Tissue-specific expression of gga-miR-26a and predictive analysis of its target genes

作　　者：李瑞瑞 张子晓 赵振华[1] 韩威[1] 向海 王钱保 黄正洋 李春苗 宗毅 黄华云[1] Li Ruirui

机构地区：[1]江苏省家禽科学研究所,江苏扬州225125 [2]佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室,广东佛山528225 [3]河北科技师范大学,河北秦皇岛066600

出　　处：《江苏农业科学》2024年第5期64-69,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-41-Z05);江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目[编号:JBGS(2021)109、JBGS(2021)029];国家家养动物种质库建设项目(编号:2023);国家自然科学基金(编号:32102538)。

摘　　要：为初步阐明gga-miR-26a在鸡脂肪沉积中的作用,以矮小品系S3系(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材,采用实时荧光定量PCR法检测gga-miR-26a在2个品种不同生长发育时期肝脏、腹脂及腿肌组织,腹脂和肌内脂肪细胞增殖期和分化期的表达变化,并利用生物信息学的方法,对gga-miR-26a靶基因进行预测和分析。结果表明,gga-miR-26a在S3系鸡(DW)和隐性白羽鸡(RR)16 W时肝脏组织中的表达存在显著的品种差异,S3系鸡在5个发育阶段表达均高于隐性白羽鸡;腹脂组织中,gga-miR-26a在0 W时存在极显著的品种差异(P<0.01)且显著高于其他周龄;gga-miR-26a在腿肌组织中的表达无显著的品种差异(P>0.05);在脂肪细胞中,gga-miR-26a在分化4 d的表达显著高于增殖期(P<0.05)。利用TargetScan、miRDB、miRmap等3个软件对gga-miR-26a靶基因进行预测,共预测到163个交集靶基因;GO及KEGG分析提示gga-miR-26a可能通过靶向调节PTEN、ULK2和PRKCD的表达,进而调控鸡的脂肪沉积。综上所述,gga-miR-26a在2个品种鸡脂肪相关组织及脂肪细胞中均有表达,且具有显著的品种差异;gga-miR-26a参与了鸡的脂肪沉积过程,PTEN、ULK2和PRKCD可能是gga-miR-26a调控脂肪沉积的预测靶基因。

关 键 词：gga-miR-26a 鸡 表达特性 靶基因 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]