新型冠状病毒E蛋白的结构特征及抗原表位分析  

作　　者：邹淑慧[1] 宋丽云 张丽琴[1] 刘奕红 刘聪[1] 

机构地区：[1]赣州市人民医院检验科,江西赣州341000

出　　处：《实验与检验医学》2024年第1期6-8,108,共4页Experimental and Laboratory Medicine

基　　金：江西省卫生健康委科技计划项目,编号SKJP_220201512。

摘　　要：目的 基于生物信息学分析新型冠状病毒E蛋白的结构特征,并筛选出潜在的B细胞、T细胞抗原表位。方法 通过多种生物信息软件分析SARS-CoV-2 E蛋白的一级结构、跨膜区域、二级结构,B细胞表位、T细胞相关表位并计算其人口覆盖率。结果 SARS-CoV-2 E蛋白含有75个氨基酸残基,脂溶性高,是疏水性蛋白,存在一个跨膜结构区域12-34aa,二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主。筛选出一个可能的B细胞抗原表位,并发现与MHC Ⅰ类和MHC Ⅱ类结合的10种肽是疫苗设计的有希望的候选者,这些候选表位可分别覆盖世界88.5%和99.99%的人群。结论 通过生物信息学分析了新型冠状病毒E蛋白的结构特征;筛选出潜在的B细胞、T细胞抗原表位,其中多个T细胞表位人群覆盖率较高,有希望成为疫苗候选表位。

关 键 词：新冠病毒 E蛋白 抗原表位 人口覆盖率 

分 类 号：R563.1[医药卫生—呼吸系统]