基于高通量测序分析苗药血人参根和根瘤内生菌的多样性  

作　　者：成婷婷 朱攀攀 周涛 张永萍 王崇敏 李军 

机构地区：[1]贵州中医药大学中药民族药资源研究院,贵州贵阳550025 [2]贵州中医药大学药学院,贵州贵阳550025

出　　处：《中药材》2024年第1期33-38,共6页Journal of Chinese Medicinal Materials

基　　金：国家自然科学基金联合基金项目(U1812403);贵州省科技计划项目(黔科合后补助[2020]3003)。

摘　　要：目的:探究血人参根和根瘤内生细菌的组成差异,筛选优势内生菌菌株。方法:通过对16S rRNA基因进行高通量测序,对血人参根及根瘤中内生菌进行物种注释、分类、物种多样性和组间差异分析。结果:血人参根和根瘤内生菌总计含有5 574个OTU,隶属于30门79纲192目324科587属。根部的内生菌总计有5 518个OTU,在门分类水平上相对丰度较高的主要为变形菌门Proteobacteria、放线菌门Actinobacteriota,在属水平上相对丰度较高的为游动放线菌属Actinoplanes和norank_f__Kineosporiaceae属,其平均相对丰度分别为18.60%、10.05%;根瘤中内生菌总计有895个OTU,在门分类水平上相对丰度较高的为变形菌门Proteobacteria,在属水平上慢生根瘤菌属Bradyrhizobium占据绝对优势,其平均相对丰度为97.87%。血人参根瘤中内生菌的Shannon、ACE及Chao指数均显著低于根中(P<0.05)。根瘤内参与氨基酸的转运和代谢,细胞的复制、重组和修复,细胞的生物发生等功能菌群相对丰度较高。结论:血人参根瘤中内生菌以埃氏慢生根瘤菌和大豆慢生根瘤菌为主,且与根部相比,物种多样性水平低、群落结构更为单一、物种分布不均匀。

关 键 词：血人参 根部内生菌 16S rRNA高通量测序 微生物多样性 慢生根瘤菌 

分 类 号：R282.2[医药卫生—中药学]