基于psbA-trnH标记的红花龙胆野生居群遗传多样性研究  被引量:2

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作  者:任得强 王仕梅 李梅 魏升华 

机构地区:[1]贵州中医药大学药学院,贵州贵阳550025

出  处:《时珍国医国药》2024年第3期648-651,共4页Lishizhen Medicine and Materia Medica Research

基  金:贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2023]一般468);贵中医博士启动资金项目(贵中医博士启动[2019]67号)。

摘  要:目的 对贵州、云南等18个产地111份红花龙胆分子样品进行检测,为红花龙胆的分类鉴别及遗传研究提供参考。方法 研究采用叶绿体基因psbA-trnH序列进行扩增并测序,进行序列差异分析、单倍型分析及遗传多样性分析。结果 111条红花龙胆叶绿体基因psbA-trnH序列扩增成功率和测序成功率分别为100.00%和94.90%;psbA-trnH序列差异分析结果表明,保守位点337个,变异位点24个,简约信息位点24个,二倍简并位点87个,四倍简并位点26个;遗传距离分析结果表明,居群间遗传距离变化范围是0~0.032,平均遗传距离为0.017;18个红花龙胆居群的序列共产生多态(分离)位点数S为9,突变总数(Eta)为11,单倍型数(h)为7个,单倍型(基因)多样性(Hd)为0.667,核苷酸多样性(Pi)为0.012,单倍型多样性方差(Vh)值0.001、单倍型多样性标准差(Sh)值0.032,遗传分化系数为0.494,基因流为0.200;经聚类分析,psbA-trnH序列易于将红花龙胆与外类群区分,且将红花龙胆18个野生居群聚为两类。结论 叶绿体基因psbA-trnH序列可应用于红花龙胆种质资源的遗传多样性研究中,不同产地红花龙胆遗传变异丰富,在进化上存在一定的地域性特征。

关 键 词:红花龙胆 psbA-trnH序列 野生居群 遗传多样性 

分 类 号:R282.5[医药卫生—中药学]

 

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