川乡黑猪重要经济性状SNP位点分型及分子系谱构建  

作　　者：杨坤 安瑞 杨雪梅[1] 顾以韧[1] 陈晓晖[1] 吕学斌[1] 

机构地区：[1]四川省畜牧科学研究院动物遗传育种四川省重点实验室,四川成都610066

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第6期133-137,共5页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家重点研发项目(2021YFD1301101、2021YFD 1301104);四川省重大科技专项(2021ZDZX0011、2021ZD ZX0008);国家自然科学基金区域创新发展项目(U19A2036);四川省重点研发项目(2023YFN0088、2021YFYZ0030、2021YFYZ0009、2020YFN0147、2022YFN0047);国家现代农业产业技术体系(CARS-35);现代农业产业技术体系四川生猪创新团队(sccxtd-2023-08);四川省财政专项(SASA2023CZ YX001);简阳市天府农业科创园科技合作项目(SZ202301)。

摘　　要：本研究旨在分析川乡黑猪重要经济性状因果突变和紧密关联SNP位点基因型分布情况,构建川乡黑猪分子系谱。利用全基因组SNP芯片技术对样本进行扫描分析,通过主成分分析、计算遗传距离、ROH分析等对公猪亲缘关系和血统进行划分,解析川乡黑猪的群体结构和遗传多样性。结果显示:川乡黑猪群体中采食量、氟烷(Hal)基因和酸肉基因2(RN2)已完全剔除非优势基因q;体长基因无QQ基因型和Qq杂合基因型,qq非优势基因型频率达100%;抗仔猪腹泻和多胸椎数基因Qq、qq基因型总比例分别为18.07%和26.10%,其中qq基因型比例为3.21%和2.01%;公猪精液品质和酸肉基因1(RN1)的Qq、qq基因型总比例较高,分别为45.78%和34.54%,并且Qq基因型比例均超过30%;多肋骨数和耗料增重比基因中优势基因型QQ比例只有18.47%和47.79%,低于50%。公猪群体主成分分析和聚类分析结果显示,该群体可被划分为16个不同的家系。以上结果表明,川乡黑猪的选育可着重于提高抗仔猪腹泻、多胸椎数、多肋骨数、公猪精液品质、酸肉和耗料增重比等基因的优势基因型频率,并结合亲缘关系和家系划分结果,通过分子标记辅助选择技术进一步优化种群结构。

关 键 词：川乡黑猪 经济性状 SNP 分子系谱 

分 类 号：S813.9[农业科学—畜牧学]