基于转录组学的牦牛不同部位嫩度差异研究  

Study on tenderness difference in different parts of yak based on transcriptomics

作　　者：林青[1] 吴海玥[2] 胡蓉[2] 闫忠心[2,3] 刘云娜 Lin Qing

机构地区：[1]青海大学农牧学院,青海西宁810016 [2]青海大学畜牧兽医科学院,青海西宁810016 [3]青海省牦牛工程技术研究中心,青海西宁810016

出　　处：《江苏农业科学》2024年第11期172-179,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家重点研发计划(编号:2022YFD1602304);青海省科技计划(编号:2023-NK-135)。

摘　　要：为比较牦牛肉不同部位嫩度的差异,以及研究嫩度涉及的基因和途径的运输与合成之间的平衡,以牦牛外脊肉(WJR)、肩肉(JR)、黄瓜条(HGT)3个部位为模型,利用Illumina Hiseq 4000高通量转录组测序技术,分析3个部位中的共同高表达基因及显著差异基因。结果显示,JR/HGT/WJR中共同高表达基因为131个,JR/HGT、WJR/HGT和WJR/JR等3组中差异表达基因分别为607、713、295个。通过对3个部位的共同高表达基因聚类分析,初步筛选出11种与嫩度相关候选的基因:肌球蛋白轻链(MYL1、MYL2),肌凝蛋白家族(TPM1、TPM2),编码横纹肌凝蛋白轻链亚基(MYLPF),肌球蛋白重链(MYH1、MYH2、MYH7),肌球蛋白结合蛋白(MYBPC2)、肌结蛋白(MYOT),Cal-sarcin-2基因(MYOZ1)。通过对3个部位差异基因的生物信息学分析,发现6种与嫩度相关的基因:肌凝蛋白β基因(TPM2)、肌凝蛋白γ基因(TPM3),肌球蛋白轻链2(MYL2),肌球蛋白轻链激酶(MYLK3、MYLK4),肌球蛋白重链(MYH6)。最终从3个不同部位中共挖掘出15种影响嫩度的候选基因,这些基因主要通过氧化磷酸化、MAPK信号通路和氮代谢等途径调控嫩度。

关 键 词：青海牦牛 转录组学 不同部位 嫩度品质 生物信息学分析 

分 类 号：S823.851[农业科学—畜牧学]