刺五加NAC转录因子基因的适应性进化分析  

Adaptive Evolutionary Analysis of the NAC Transcription Factor Genes of Eleutherococcus senticosus

作　　者：董靖 赵雪蕾 王硕 龙月红 邢朝斌 DONG Jing;ZHAO Xuelei;WANG Shuo

机构地区：[1]华北理工大学生命科学学院,河北唐山063210

出　　处：《林业科技通讯》2024年第5期33-38,共6页Forest Science and Technology

基　　金：中央引导地方科技发展资金项目(236Z2501G)。

摘　　要：对药用植物刺五加(Eleutherococcus senticosus)的NAC转录因子进行适应性进化分析,使用MEC模型和PAML软件中的3种模型:分支模型、位点模型、分支-位点模型的SLAC、FEL和REL算法对刺五加的116条NAC基因进行适应性进化分析。结果表明:从PAML模型与MEC模型的分析结果中未发现正选择位点,而在分支与位点模型中负选择起主导作用;算法SLAC、REL和FEL的分析结果同样显示,刺五加的NAC转录因子中存在大量负选择位点。通过亚细胞定位和二级结构分析发现,NAC转录因子发挥作用的位置大部分在细胞核中并且大量负选择位点位于无规则卷曲中。结论:纯化选择在NAC转录因子进化过程中发挥主要作用,而NAC转录因子发挥作用的部位可能在无规则卷曲的二级结构中。本文为进一步探究刺五加NAC转录因子的系统进化关系奠定了基础。

关 键 词：刺五加 Eleutherococcus senticosus NAC转录因子 适应性进化 

分 类 号：S567.19[农业科学—中草药栽培] Q343.1[农业科学—作物学]