藜麦抗坏血酸过氧化物酶基因(CqAPX)家族生物信息学与表达模式分析  

Genome-Wide Identification and Expression Pattern Analysis of AscorbateOxidase Gene Family of Quinoa(Chenopodium quinoa Willd.)

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作  者:刘文莉 陈方军 郭善利[1] 陈世华[1,2] LIU Wenli;CHEN Fangjun;GUO Shanli;CHEN Shihua(School of Life Sciences,Yantai University,Yantai 264005,China;China Salt Field Quinoa(Dongying)Seed Technology Co.,Ltd.,Dongying 257300,China)

机构地区:[1]烟台大学生命科学学院,山东烟台264005 [2]中藜盐地藜麦(东营)种业科技有限公司,山东东营257300

出  处:《烟台大学学报(自然科学与工程版)》2024年第3期273-280,共8页Journal of Yantai University(Natural Science and Engineering Edition)

基  金:山东省“渤海粮仓”科技示范工程升级版计划项目(2019BHLC001);山东省农业良种工程(2023LZGC011)。

摘  要:为研究藜麦APX(CqAPX)基因结构和功能,利用生物信息学方法和公共数据库对CqAPX基因家族成员的理化性质、保守基序、基因结构和顺式元件以及表达谱进行分析。结果表明,CqAPX具有较高的进化保守性,可划分为4个类群。此外,CqAPX基因的启动子含有丰富的与胁迫相关的顺式作用元件,CqAPX基因在根、叶、花序和种子中组织特异性表达。干旱、盐和热胁迫处理能够显著改变CqAPX基因的表达。In order to explore the structure and function of quinoa APX(CqAPX)gene,bioinformatics methods and public databases are used to analyze the physicochemical properties,conserved motifs,gene structure and cis-elements,and expression profiles of members of the CqAPX gene family.The results show that CqAPX has high evolutionary conservatism and can be divided into four taxa.In addition,the promoter of the CqAPX gene is rich in stress-related cis-acting elements,and CqAPX gene is tissue-specific expression in roots,leaves,inflorescence,and seeds.Drought,salt,and heat stress treatments can significantly alter the expression of CqAPX genes.

关 键 词:藜麦 抗坏血酸过氧化物酶 非生物胁迫 基因家族 

分 类 号:Q751[生物学—分子生物学]

 

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