灯盏花3-O-葡萄糖基转移酶基因的克隆、表达及生物信息分析  

Cloning,expression and bioinformatics analysis of 3-O-glucosyltransferase gene from Erigeron breviscapus

作　　者：莫维淼 王梦钦 徐达 何凤明[1] 陈晓波[1] 张云峰[1,2] MO Weimiao;WANG Mengqin;XU Da;HE Fengming;CHEN Xiaobo;ZHANG Yunfeng

机构地区：[1]云南师范大学生命科学学院,云南昆明650500 [2]教育部可持续能源开发利用工程中心,云南昆明650500

出　　处：《南方农业》2024年第13期1-6,共6页South China Agriculture

基　　金：国家自然科学基金项目(3196020302)。

摘　　要：从灯盏花cDNA中克隆出灯盏花3-O-葡萄糖基转移酶基因(EbUF3GT)并对其序列进行生物信息学分析以预测其功能。根据课题组前期的转录组分析数据,筛选出了灯盏花EbUF3GT基因的部分序列,并利用RACE基因克隆方法,获得灯盏花EbUF3GT基因的全长cDNA,运用生物信息学分析该基因的相似性和同源性、编码蛋白的理化性质,并通过荧光定量PCR检测基因在植物不同部位中的表达情况。结果发现,克隆cDNA的ORF长1 395 bp,编码464个氨基酸,其蛋白分子量51 850.48,理论等电点为5.48。EbUF3GT蛋白由24.78%的α-螺旋(Alpha helix)、22.20%的延伸(Extendedstand)、53.02%的随机卷曲(Random coil)组成,属于GT家族中的B类型且包含PSPG盒的保守序列。灯盏花的EbUF3GT基因与青蒿、艾草亲缘关系较近,属同一个分支,它们的UF3GT具有共同起源。EbUF3GT基因在根、茎、叶、花这几个部位都能表达,尤其在花中的表达量最高,干旱胁迫也会增加它的表达。结论:通过对EbUF3GT研究,为进一步探索EbUF3GT基因在灯盏花类黄酮次生代谢产物合成和调控机制提供了重要的理论依据。

关 键 词：灯盏花 糖基转移酶 黄酮 基因克隆 生物信息学 

分 类 号：Q785[生物学—分子生物学]