铁皮石斛DoPLR基因的克隆、序列分析及表达分析  

作　　者：于莹 陈宏宇 彭松平 杨奕樱 

机构地区：[1]贵州中医药大学基础医学院,贵州贵阳1550025 [2]贵州中医药大学分子诊断研究中心,贵州贵阳550025 [3]贵州中医药大学药学院,贵州贵阳550025

出　　处：《时珍国医国药》2024年第7期1776-1780,共5页Lishizhen Medicine and Materia Medica Research

基　　金：贵州省基础研究(自然科学)项目(黔科合基础-ZK[2021]一般521)。

摘　　要：目的进一步阐明铁皮石斛(Dendrobium officinale)中木脂素生物合成的分子调控机制,克隆铁皮石斛木脂素合成关键酶基因DoPLR,分析其序列特征及表达模式。方法根据NCBI中铁皮石斛PLR基因序列设计特异引物,利用PCR技术克隆铁皮石斛DoPLR基因,利用生物信息学软件分析DoPLR基因及编码蛋白的结构特征。利用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测DoPLR基因在铁皮石斛不同组织部位、不同非生物胁迫、不同激素处理等情况下的表达模式。结果克隆获得铁皮石斛DoPLR基因,该基因的开放阅读框(ORF)长度为933bp,编码310个氨基酸,蛋白相对分子质量和等电点分别为36.4 KDa和6.54;该蛋白含有NAD(P)~+结合结构域,为亲水性蛋白,可能在细胞核中发挥作用,有29个磷酸化位点;该蛋白二级结构含有37.42%的α-螺旋、7.42%的β-折叠、36.77%的无规则卷曲和18.39%的延伸链;聚类分析表明该蛋白与亚麻LuPLR蛋白聚在一个分支上;互作蛋白分析表明丝氨酸苏氨酸蛋白激酶、转录因子bHLH63等蛋白可能与该蛋白发挥作用密切相关;qRT-PCR结果表明,DoPLR基因在不同组织部位、不同激素处理、不同非生物胁迫下的表达模式均存在差异,推测该基因可能参与铁皮石斛对非生物胁迫和激素的响应。结论克隆获得了铁皮石斛DoPLR基因,分析了其序列特征和表达模式,为深入研究DoPLR基因的功能和铁皮石斛木脂素生物合成分子机制奠定基础。

关 键 词：铁皮石斛 木脂素 PLR基因 序列分析 表达分析 

分 类 号：R2-03[医药卫生—中医学]