非洲猪瘟病毒p10蛋白和p49蛋白的生物信息学分析及表位预测  

Bioinformatics analysis and epitope prediction of p10 and p49 proteins of African swine fever virus

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作  者:孙卓雅 王梦翔 宋金星 秦晓东 孙俊如 周蕾 吴亚楠 张改平[1,2,3] Sun Zhuoya

机构地区:[1]河南农业大学动物医学院/国家动物免疫学国际联合研究中心,河南郑州450046 [2]河南农业大学动物医学院/动物病原与生物安全教育部重点实验室,河南郑州450046 [3]龙湖现代免疫实验室,河南郑州450046

出  处:《江苏农业科学》2024年第15期195-202,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:国家自然科学基金(编号:32002292);河南省重大科技专项(编号:221100110600)。

摘  要:运用多种生物信息技术对非洲猪瘟病毒(ASFV)Georgia 2007/1株p10蛋白和p49蛋白的理化性质、二级及三级空间结构、抗原性、抗原决定簇进行初步分析,并预测其B、T淋巴细胞优势表位。结果表明,p10是亲水性蛋白,含有2个抗原决定簇,该蛋白α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链的比例为32.05%、11.54%、52.56%和3.85%;p49同样是亲水性蛋白,含有17个抗原决定簇,其α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链的比例依次为29.91%、7.53%、55.94%和6.62%。基于以上分析,p10不适合用于ASF疫苗制备的候选蛋白;而p49作为亲水性衣壳蛋白,具有一定免疫原性,有望成为疫苗研制的备选蛋白,为ASFV蛋白研究和疫苗研发提供一定参考。

关 键 词:非洲猪瘟 生物信息学 表位预测 

分 类 号:S855.3[农业科学—临床兽医学]

 

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