基于基因组重测序的公猪精液品质候选基因研究  

作　　者：雷润雨 阳文攀 冯越 周佳伟 徐忠 李梓芃 吴俊静[1] 乔木[1] 彭先文[1] 梅书棋[1] 张宇[1] 

机构地区：[1]湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉430064 [2]华中农业大学动物科学技术学院,湖北武汉430070 [3]福建傲芯种业科技有限公司,福建漳州363000

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第8期81-86,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：武汉市重大专项(2022021302024853);湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2021-620-000-001-18);国家生猪产业技术体系(CARS-35)。

摘　　要：本研究基于某企业公猪站172头纯种大白猪10 316条精液品质记录,分别针对精液体积、精液密度、有效精子密度、精子活力、精子畸形率以及直线运动比例进行统计分析,绘制每种性状的分布情况。相关性分析发现,精液体积与精液密度呈负相关,精子活力与直线运动比例呈正相关、与畸形率呈负相关。进一步分别选取精液体积性状极端高和极端低的10个样品,提取基因组DNA,进行15×全基因组重测序,共获得高质量SNPs和InDels 11 400 036个。以10 kb为window、5 kb为步长进行遗传分化系数(Fixation Index,Fst)分析,以0.1%的window为阈值,筛选精液体积高低组的极端分化区域,共获得4.43Mb的区域,包含142个候选基因。利用David工具进行GO富集分析,结果表明候选基因主要参与细胞分裂(GO:0051301)、白细胞运动(GO:1903238)、信号转导(GO:0007165)以及受体聚集(GO:0043113)等生物学过程。其中CDK6、CDK13、CDK14、STAG1和TNKS等基因主要参与细胞分裂过程,且均有与精子质量相关的报道,可作为影响公猪精液品质的候选基因,为后续分子标记的发掘提供理论依据。

关 键 词：精液品质 公猪 精液体积 候选基因 

分 类 号：S828.3[农业科学—畜牧学]