硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测  

作　　者：任双 吴俊静[2] 彭先文[2] 张志红 周佳伟 梅书棋[2] 乔木[2] 杜志强 

机构地区：[1]长江大学动物科学技术学院,湖北荆州434020 [2]湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉430064 [3]江夏区农业农村局农业行政执法大队,湖北武汉430023

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第8期116-121,128,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：湖北省自然科学基金杰出青年项目(2023AFA091);国家重点研发计划项目(2021YFD1301101);国家生猪产业技术体系项目(CARS-35);湖北洪山实验室重大项目(2021hszd 003)。

摘　　要：本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因(Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A)启动子区序列的结构特性,确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点,为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测,在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区,根据预测结果设计7对启动子缺失片段引物,以硒都黑猪血液基因组DNA为模板,通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因5'端7个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体,以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测,并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明,NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290~+109bp的位置(ATG作为+1),该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5和SP1等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。

关 键 词：硒都黑猪 NT5C1A 核心启动子区 转录因子 生物信息学 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]