不同谱系D型流感病毒HEF蛋白N-糖基化位点和B细胞表位预测分析  

作　　者：蒋智勇 周霞 李春玲 楚品品 勾红潮 李艳 卞志标 刘建营 翟少伦 

机构地区：[1]广东省农业科学院动物卫生研究所猪病研究室/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室/农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站,广州510640 [2]广东省农业技术推广中心,广州510640

出　　处：《中国动物保健》2024年第10期123-128,共6页China Animal Health

基　　金：广东省自然科学基金项目(No.2021A1515010524)。

摘　　要：D型流感病毒(IDV)是一种近年来新发现的正粘病毒科D型流感病毒属成员,可引起牛、猪、豚鼠等多种动物的呼吸道疾病,具有潜在的人兽共患性。基于HEF基因遗传多样性,IDV可分为5个不同的谱系,分别是D/OK、D/660、D/Yama2016、D/Yama2019和D/CA2019谱系。不同于甲型、乙型流感病毒,IDV的潜在N-糖基化位点主要集中分布在HEF基因上。为系统了解不同谱系毒株HEF蛋白的N-糖基化位点和B细胞表位,从Gen Bank数据库获得151条全长HEF基因序列,通过使用MEGA-X生物信息学软件构建遗传进化树,并用在线工具进行各毒株N-糖基化位点和线性B细胞表位预测分析。结果表明IDV的HEF蛋白具有6~8个潜在的N-糖基化位点,其中有2个N-糖基化位点(N146和N613)在不同谱系间相同,有6个N-糖基化位点(N28、N54、N249、N346、N390和N513)在不同谱系间存在差异。B细胞表位在不同谱系间有3个保守的表位和8~9个各谱系独特的表位。线性B细胞表位的预测将有助于设计激活体液反应的多表位疫苗,预测结果还需要体外和体内实验证实来证明该应用的可行性。

关 键 词：D型流感病毒 谱系 HEF蛋白 N-糖基化位点 B细胞表位 预测 

分 类 号：S85[农业科学—兽医学]