基于转录组分析枇杷响应干旱胁迫的分子机制  

Analysis of molecular mechanism of Eriobotrya japonica response to drought stress based on transcriptome

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作  者:赵双 尤伟忠 汪溢 郄红丽[2,3] Zhao Shuang

机构地区:[1]苏州农业职业技术学院,江苏苏州215008 [2]江苏省太湖常绿果树技术推广中心,江苏苏州215107 [3]江苏省农业种质资源保护与利用平台,江苏南京210014

出  处:《江苏农业科学》2024年第17期27-34,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:江苏省高等学校基础科学(自然科学)研究面上项目(编号:22KJD210003);江苏省珍稀树种白沙枇杷种质资源保护与培育长期科研基地项目(编号:LYKJ[2020]28);江苏省现代农业(特色果树)产业技术体系建设专项(编号:JATS[2021]395);苏州农业职业技术学院博士提升计划科研启动基金(编号:BS[2022]01)。

摘  要:为了探索枇杷对于干旱胁迫响应和耐受性的分子机制,鉴定可用于培育抗旱枇杷新品种的关键基因,为枇杷抗旱机制提供理论依据,以白玉枇杷为试验材料,通过转录组测序(RNA-Seq)筛选响应干旱胁迫的差异表达基因。以正常供水为对照,进行短期干旱胁迫处理,RNA-Seq筛选差异表达基因(DEG),并对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析。结果表明,RNA-Seq共鉴定出3270个DEG,其中上调1810个,下调1460个。GO富集分析表明,一些胁迫响应基因在干旱处理后显著上调。KEGG富集分析表明,植物MAPK信号通路、植物激素信号转导、类胡萝卜素生物合成等相关DEG在响应胁迫中发挥关键作用。对DEG深入分析发现,干旱胁迫后,抗氧化酶基因、脱落酸(ABA)生物合成基因NCED、ABA信号通路基因显著上调。此外,通过分析转录因子,发现枇杷主要通过调控bHLH、bZIP、AP2/ERF、GRAS、HD-Zip、MYB、MYB_related、NAC、WRKY这9个家族转录因子的表达来响应干旱。

关 键 词:枇杷 干旱胁迫 转录组分析 差异基因表达 

分 类 号:S667.301[农业科学—果树学]

 

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