小麦DBB基因家族的生物信息学与表达分析  

Bioinformatics and expression analysis of wheat DBB gene family

作　　者：连少英 姜晓君 张修引 郭灿 李磊[3] 张庆琛[4] 史国礼 倪永静 Lian Shaoying

机构地区：[1]商丘市农林科学院,河南商丘476000 [2]河南省小麦春季冻害鉴定工程技术研究中心,河南商丘476000 [3]河南农业大学国家小麦工程技术研究中心/河南省小麦技术创新中心,河南郑州450046 [4]商丘师范学院,河南商丘476000

出　　处：《江苏农业科学》2024年第18期59-67,共9页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家重点研发计划(编号:2017YFD0301101、2023YFD2301502);河南省科技攻关项目(编号:232102110018)。

摘　　要：为了解小麦DBB转录因子基因家族成员的基本特征,分析其在基因结构、蛋白结构、系统发育进化树、染色体定位、不同物种间的进化情况,并对小麦DBB基因家族成员在小麦不同组织中的表达水平进行分析。基于小麦中国春的基因组数据,共鉴定得到29个DBB基因家族成员,它们不均匀地分布在小麦15条染色体上;系统发育进化树将小麦DBB蛋白分为4个亚族,其中拟南芥DBB基因家族成员在聚类中显示出明显的特异性,与其他物种具有较远的进化关系;motif1位于小麦DBB蛋白的保守结构域,大部分TaDBB基因含有2~3个外显子,最多为5个外显子;小麦DBB基因的启动子区域具有丰富的调控植物生长发育、响应激素以及非生物胁迫的顺式作用元件,暗示TaDBB基因在调控小麦生长发育和胁迫响应中发挥着多种潜在作用;小麦DBB基因在基因组内的进化主要是通过基因片段复制完成的,且同源基因间的片段复制在进化过程中发挥着主导作用;不同物种间的进化结果表明,小麦DBB基因与玉米具有更近的亲缘关系;转录组数据的基因表达谱分析显示,TaDBB1、TaDBB15和TaDBB21基因的表达具有明显的组织特异性。该结果将为后续解析DBB基因在小麦中的生物学功能奠定基础。

关 键 词：小麦 DBB基因家族 生物信息学 表达分析 

分 类 号：S512.103[农业科学—作物学] S330