Drishti Paint 3.2:a new open-source tool for both 2D and 3D segmentation  

Drishti Paint 3.2:一种开源的综合二维与三维分割的新工具

作　　者：WANG Meng-Jun Ajay LIMAYE LU Jing 王梦君;Ajay LIMAYE;卢静(中国科学院古脊椎动物与古人类研究所,中国科学院脊椎动物演化与人类起源重点实验室,北京100044;中国科学院大学,北京100049;澳大利亚国家计算中心,澳大利亚国立大学,堪培拉ACT 2601)

机构地区：[1]Key Laboratory of Vertebrate Evolution and Human Origins of Chinese Academy of Sciences,Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100044 [2]University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049 [3]National Computational Infrastructure,Australian National University Canberra,ACT 2601

出　　处：《古脊椎动物学报（中英文）》2024年第4期313-320,共8页Vertebrata Palasiatica

基　　金：国家自然科学基金(批准号:42130209)资助。

摘　　要：X-ray computed tomography(CT)has been an important technology in paleontology for several decades.It helps researchers to acquire detailed anatomical structures of fossils non-destructively.Despite its widespread application,developing an efficient and user-friendly method for segmenting CT data continues to be a formidable challenge in the field.Most CT data segmentation software operates on 2D interfaces,which limits flexibility for real-time adjustments in 3D segmentation.Here,we introduce Curves Mode in Drishti Paint 3.2,an open-source tool for CT data segmentation.Drishti Paint 3.2 allows users to manually or semi-automatically segment the CT data in both 2D and 3D environments,providing a novel solution for revisualizing CT data in paleontological studies.计算机断层扫描(CT)技术在近几十年来被广泛应用于古生物学相关研究领域。研究者借助CT扫描技术可以无损获得化石内部精细信息,进一步对材料进行深入研究。但是,如何对CT数据进行高效的三维分割与重建仍是研究者们在使用三维数据时面临的主要问题。大多数CT数据分割软件都采用二维分割的传统方法,难以直接对三维结果进行实时修正。介绍了三维可视化开源软件Drishti Paint 3.2版本中的曲线模式(Curves Mode)及其使用方法。该软件为研究者提供了同时在二维切片及三维窗口手动或半自动分割CT数据的新工具,为如何对古生物学研究中化石CT数据进行高效的三维分割与重建提供了新思路。

关 键 词：X-ray computed tomography(CT) 2D and 3D segmentation 3D reconstruction Drishti Paint 

分 类 号：TP391.4[自动化与计算机技术—计算机应用技术]