基准剂量估计R软件包bmd的改进与应用  

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作  者:袁苗 彭雯洁 王青青[1] 崔靖 张婷 周小林[2,3] 余红梅 

机构地区:[1]山西医科大学公共卫生学院卫生统计教研室,030001 [2]中国辐射防护研究院 [3]国家环境保护辐射环境与健康重点实验室 [4]重大疾病风险评估山西省重点实验室

出  处:《中国卫生统计》2024年第5期766-768,774,共4页Chinese Journal of Health Statistics

基  金:生态环境部重点地区环境与健康调查、监测和风险评估(21111011101EHSM);国家环境保护辐射环境与健康重点实验室平台开放基金(YP21020203)。

摘  要:目的本研究旨在构建一个更加便捷的R扩展包简化基准剂量估计(benchmark dose,BMD)的计算和操作过程。方法使用R 4.1.3对原有R软件包bmd进行修改和整合,构建一个R扩展包。采用研究中封装完成的R扩展包将微囊藻毒素LR(microcystin-LR,MCLR)的数据与18种剂量-反应模型拟合,根据Akaike信息标准(Akaike information criterion,AIC)最小原则,得到最佳拟合模型下MCLR的BMD和基准剂量下限(benchmark dose lower confidence limit,BMDL)。结果封装后的R扩展包将原有bmd包的运算过程进行简化。MCLR的基准剂量估计中2个参数的Weibull type 2模型AIC值最小,在该模型下,MCLR的BMD和BMDL分别为1.39 mg/kg和0.49 mg/kg。结论封装后的R扩展包简化了BMD的计算和操作过程,可以同时得到18种剂量-反应模型的AIC、BMD和BMDL,直观选择AIC最小的模型相对应的BMD及BMDL。

关 键 词:基准剂量估计 剂量-反应 微囊藻毒素 

分 类 号:R195[医药卫生—卫生统计学]

 

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