全长转录组数据揭示骨骼肌细胞增殖与分化过程中的基因表达以及可变剪切特征  

作　　者：崔芳芳 蒋红霞 许继国 陈彪 

机构地区：[1]南昌师范学院,南昌330032 [2]江西农业大学,南昌330045

出　　处：《养禽与禽病防治》2024年第12期43-47,共5页Poultry Husbandry and Disease Control

基　　金：国家自然科学基金(32460832);江西省畜禽良种联合攻关项目(2022JXCQZY02);江西省自然科学基金(20232BAB205061)。

摘　　要：产肉性能是家禽产业重要的经济性状,研究骨骼肌的生长发育对于家禽育种具有重要意义。本研究通过Oxford Nanopore测序平台对鹌鹑QM7成肌细胞系在增殖期与分化期进行全长转录组测序,旨在探讨其骨骼肌发育的分子机制。结果显示,在增殖期和分化期共鉴定出15295个基因,其中798个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)在两个时期之间存在显著变化。这些DEGs富集于相关生物学过程,如肌肉系统发育和ECM一受体相互作用等。可变剪切分析表明,增殖期共识别到6391次、分化期6270次可变剪切事件,其中以第一个外显子可变剪切最为普遍。KEGG富集分析表明,差异表达可变剪切基因主要涉及运动蛋白和心脏肌肉收缩等信号通路。本研究结果为理解鹑骨骼肌发育的调控机制提供了重要的理论依据,并为鹌鹑育种研究奠定了基础。

关 键 词：鹌鹑 骨骼肌 发育 全场转录组 纳米孔测序 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]