山羊CD14基因及其编码蛋白的生物信息学分析  

Bioinformatics Analysis of Goat CD14 Gene and Its Encoded Protein

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作  者:雷国栋 曾亚英 刘树梅 涂雷 王子奥 Lei Guodong

机构地区:[1]湘西土家族苗族自治州畜牧水产事务中心,湖南吉首416000 [2]内蒙古阿拉善盟农畜产品质量安全中心,内蒙古阿拉善010013 [3]龙山县桂塘镇农业综合服务中心,湖南龙山416817 [4]龙山县畜牧兽医技术推广服务中心站,湖南龙山416899 [5]湖南生物机电职业技术学院动物科技学院,湖南长沙410127

出  处:《贵州畜牧兽医》2024年第6期12-15,共4页Guizhou Journal of Animal Husbandry & Veterinary Medicine

基  金:“湘西呆鲤基因组组装及比较基因组研究”湖南省自然科学基金项目(NO2024JJ7550)。

摘  要:为探究山羊CD14基因及其编码蛋白CD14的结构与功能,试验利用生物信息学软件对山羊CD14基因进化及其编码蛋白的氨基酸序列、蛋白质理化性质、蛋白质结构和互作蛋白进行分析。结果:山羊CD14基因与绵阳、四川羚羊、弯角大羚羊亲缘关系最近,物种间有较高的保守性。其编码的CD14蛋白共有373个氨基酸,为疏水稳定蛋白,其中亮氨酸含量最多,占15.8%;山羊CD14蛋白的分子式为C_(1772)H_(2864)N_(498)O_(515)S_(17),分子质量39 930.28 u,等电点为8.47;多肽链中以无规则卷曲为主,第1~20个氨基酸为跨膜蛋白;蛋白互作表明,山羊CD14蛋白通过与TLR2、TLR4、TLR6、CXCL8、SPI1、TYROBP、PLCG2、LY96、LOC10218632010、BPI 10个蛋白互作在细胞免疫中发挥作用。结论:山羊CD14基因与绵羊、四川羚羊、弯角大羚羊亲缘关系最近;其编码蛋白CD14是由373个氨基酸组成的以无规则卷曲为主的疏水性跨膜蛋白,结构稳定,与TLR2、TLR4、TLR6等10个蛋白关系紧密。

关 键 词:山羊 CD14基因 CD14蛋白 生物信息学分析 

分 类 号:S827[农业科学—畜牧学] Q75[农业科学—畜牧兽医]

 

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