基于DNA条形码对报春苣苔属进行系统发育分析  

作　　者：张梅 童琪 李晓芳 

机构地区：[1]贵州省植物园/西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室,贵州贵阳550004

出　　处：《农业与技术》2024年第24期77-81,共5页Agriculture and Technology

基　　金：贵州省基础研究计划项目(项目编号:黔科合基础-ZK[2022]一般291)。

摘　　要：报春苣苔属为苦苣苔科长蒴苣苔族的类群,该属物种为草本。草本植物物种进化较迅速,且野外杂交现象较为普遍。为了找到该属最适合建立系统发育关系的基因片段进行分类研究,本研究选取19个种的核基因(ITS)序列和叶绿体基因(trn L_F、atp B_rbc L)序列,以及2个外类群(小石蝴蝶Petrocosmea minor或者贵州半蒴苣苔Hemiboea cavaleriei)对该属进行系统发育关系重建。结果表明:核基因(ITS)建立的系统树支持率较低,但是分辨率较高且拓扑结构较好。单一叶绿体基因(trn L_F、atp B_rbc L)建成的2棵系统发育树支持率有明显提高,但是分辨率较低,且拓扑结构显示较弱。在2棵叶绿体基因树中,基因片段trn L_F建成的系统树拓扑结构相对较好,并且基因片段atp B_rbc L建成的系统树支持率较高,均为80%以上。进一步通过核基因和叶绿体基因片段综合建树,不管是在树形的拓扑结构上,还是分辨率和支持率上都有明显提高。因此,核基因ITS,叶绿体基因trn L_F、atp B_rbc L等3个DNA条形码均适合用于对报春苣苔属系统发育树的建立,但需要组合一起建树才能具有较高的可信度。由此可见,基因量越多,建立的系统发育树越稳健。

关 键 词：植物分类学 分子系统学 DNA条形码 苦苣苔科 报春苣苔属 

分 类 号：S18[农业科学—农业基础科学]