乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区克隆及分子结构特征分析  

作　　者：宋兴超 王云艳 孟金柱 安清明 赵园园 吴震洋 

机构地区：[1]铜仁学院农林工程与规划学院,贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州铜仁554300

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第12期215-223,共9页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：贵州省科技厅科技计划项目(黔科合基础-ZK[2022]一般559);贵州省高层次创新型“千”层次人才培养项目(2024-[2022]-048);贵州省重点实验室项目(黔科合平台人才[2020]2003号);贵州省教育厅重点领域项目(黔教合KY字[2020]052)。

摘　　要：本研究旨在克隆乌蒙乌骨鸡酪氨酸酶(TYR)基因启动子区序列并解析其分子结构特征,为探究该基因调控乌蒙乌骨鸡乌质性状的分子机制提供参考。以乌蒙乌骨鸡血液基因组DNA为模板,设计3对特异性引物,通过PCR扩增、Sanger测序及序列拼接方法获得TYR基因启动子区序列;采用DNAStar Lasergene和MEGA 5.0软件分别进行15个物种TYR基因启动子区序列相似性分析及系统进化树构建;利用生物信息学软件预测分析该序列核心启动子、调控元件、转录因子和CpG岛等分子结构特征。结果显示,乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区序列长3216bp(Genbank登录号:ON49713457),包括5'侧翼区2858bp和358bp部分外显子1。乌蒙乌骨鸡与其他14个物种TYR基因相似性为40.9%~99.9%,乌蒙乌骨鸡与原鸡、鹌鹑等鸡形目亲缘关系较近,与猪亲缘关系较远。-600~-59 bp可能为乌蒙乌骨鸡TYR基因候选核心启动子区域,5'侧翼区-523 bp处可能存在1个转录起始位点C,存在1个CAAT-box、3个TATA-box、16个E-box、2个进化保守区域CR1和CR2、5个5'侧翼区近端黑色素细胞特异性元件(p-MSE),不存在CpG岛。乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区存在潜在的C/EBP-α、GATA-1、Sp1、Pdx1、TBP和NF-1等转录因子。本研究成功克隆获得乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区序列,为解析该基因调控乌蒙乌骨鸡乌质性状的分子机制提供了理论依据。

关 键 词：乌蒙乌骨鸡 TYR基因 启动子区 转录因子 调控元件 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]