宏基因组二代测序肺结核及病原体特征分析  

Analysis of pathogen characteristics in pulmonary tuberculosis by metagenomicsecond-generation sequencing

作　　者：叶春幸[1] 丘国清 林缓卿 申严[1] 陈思达[1] 赖育庭 徐香琴 Ye Chunxing;Qiu Guoqing;Lin Yanqing

机构地区：[1]深圳市龙岗中心医院呼吸与危重症医学科,深圳518116

出　　处：《中华肺部疾病杂志(电子版)》2024年第6期985-990,共6页Chinese Journal of Lung Diseases(Electronic Edition)

基　　金：深圳市龙岗区医疗卫生科技计划项目[LGWJ2021⁃(13)]。

摘　　要：目的分析宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)对肺结核的诊断意义,及肺结核病原体特征和呼吸道微生物组成。方法选择2022年2月至2023年12月我院收治的疑似肺结核患者55例,采集支气管肺泡灌洗液及痰液标本,比较痰结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)培养、痰涂片镜检、mNGS检查诊断肺结核。利用生物信息学处理mNGS测序数据,分析病原体特征及呼吸道微生物组成。结果55例疑似肺结核者中确诊阳性39例(70.91%),痰涂片镜检阳性29例(52.73%),mNGS检查阳性38例(69.09%)。mNGS检查灵敏度92.31%、准确度90.91%高于痰涂片镜检(P<0.05)。mNGS检查显示病原体100株,其中肺结核61株,包括细菌30株(49.18%)、病毒19株(31.15%)、真菌12株(19.67%);非肺结核39株,包括病毒21株(53.85%)、细菌11株(28.21%)、真菌7株(17.95%)。肺结核病原体类型以细菌为主,包括结核分枝杆菌复合群、鲁兰德氏无色杆菌。非肺结核病原体类型以病毒为主,包括人类β疱疹病毒7型病原体。肺结核者与非肺结核者下呼吸道微生物组成差异显著。肺结核者主要病原体为结核分枝杆菌复合体,其次为流感嗜血杆菌、大肠杆菌和克雷伯菌等。非肺结核者微生物组成多样化,病毒病原体人类γ-疱疹病毒4、人类β-疱疹病毒7和人类β-疱疹病毒5相对丰度高。丰度差异分析显示,结核分枝杆菌在肺结核者中含量高于非肺结核者(P<0.001)。结论宏基因组测序快速确定感染的病原体类型,分析呼吸道微生物组成,对肺结核诊断或其他呼吸道感染具有临床意义。

关 键 词：肺结核 痰涂片镜检 痰结核分枝杆菌培养 宏基因组二代测序 呼吸道微生物组成 

分 类 号：R562[医药卫生—呼吸系统]