鸡Sox10基因克隆、生物信息学及组织表达分析  

作　　者：徐硕辉 张朋威 朱慧媛 宋素芳[2] 李文婷 孙桂荣[1,3] 田亚东 康相涛[1,3] 李东华 

机构地区：[1]河南农业大学动物科技学院,河南郑州450000 [2]河南牧业经济学院,河南郑州450000 [3]农业农村部畜禽资源(家禽)评价利用重点实验室,河南郑州450000

出　　处：《中国畜牧杂志》2025年第1期150-157,共8页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：中原博士后创新人才;河南省自然科学基金青年项目(202300410203);国家自然科学基金青年项目(32102540)。

摘　　要：为了探究Sox10(SRY-related HMG-box 10)氨基酸序列特征以及Sox10在淅川乌骨鸡不同组织的表达量变化,试验对淅川乌骨鸡Sox10基因CDS区进行PCR克隆并使用在线软件分析氨基酸序列,同时,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分别检测Sox10在心、肝、胸肌、腿肌和背肤的表达水平。结果表明:Sox10基因CDS区测序长度为1386bp,编码了461个氨基酸。同源性比对和系统进化树显示,淅川乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近,与鱼类最远。Sox10蛋白分子质量为49.86 ku,等电点为6.20,具有不稳定性、酸性和亲水性,且不存在跨膜区和信号肽,存在HMG结构域及55个磷酸化位点,5'端2000 bp不含甲基化位点。Sox10主要包括无规则卷曲,大部分位于细胞核,与DCT、EDNRB、Pax3、Pax7等蛋白存在互作关系,参与细胞发育过程中的DNA、蛋白质结合以及转录调节功能。qRT-PCR结果表明,Sox10在背肤的表达量显著高于心、肝、胸肌和腿肌,在肝脏和胸肌的表达量显著低于心、腿肌和背肤。以上结果为进一步探究Sox10基因对黑色素沉积的调控机制提供了理论依据。

关 键 词：淅川乌骨鸡 Sox10基因 基因克隆:生物信息学 组织表达分析 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]