鸡EGFR基因的功能分析及其对颗粒细胞中基因表达的影响研究  

作　　者：陈林 王家乡[2] 吴艳[1] 皮劲松[1] 蒲跃进 

机构地区：[1]湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉430064 [2]长江大学动物科学学院,湖北荆州434025 [3]湖北省畜牧技术推广总站,湖北武汉430064

出　　处：《中国畜牧杂志》2025年第1期212-222,226,共12页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家重点研发计划资助(2022YFD1600100);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-40、CARS-41)。

摘　　要：本文旨在研究鸡卵泡颗粒细胞EGFR基因的功能并对其过表达后进行转录组和生物信息学分析,为进一步研究EGFR基因在鸡卵泡颗粒细胞发育中的调控机制提供理论基础。利用qRT-PCR技术探索EGFR基因过表达后细胞凋亡关键基因(BCL2、c-myc、casp3)以及氧化应激相关基因(SOD2、CYP19、GPX2)的表达量,进而确定其在颗粒细胞中的功能;利用RNA-seq测序技术对EGFR基因过表达后的卵泡颗粒细胞进行转录组学分析,筛选差异表达基因,并对其进行GO和KEGG注释及qRT-PCR验证。在对照组(空载体)和试验组(EGFR基因过表达)颗粒细胞样本中分别获得2.361×10^(7)和2.399×10^(7)条Clean Reads,其中对照组和试验组共有90.61%的Clean Reads比对到鸡参考基因组上。DESeq分析发现共有1356个基因在2组间差异表达,其中790个基因上调,566个基因下调,包括与细胞功能相关基因,如SLC2A12、HSPB9、ANO1、CCL4、HMOX1、Nurr1等。GO分析发现,差异表达基因主要富集在转录正调控、DNA模板化、含有核酸酶的化合物代谢的阳性调节以及RNA代谢的正调控等过程。KEGG通路主要富集在类固醇生物合成、溶酶体和局部粘连及细胞外基质受体相互作用等过程。GO和KEGG富集结果表明,EGFR基因过表达后,SLC2A12、HSPB9、ANO1基因表达量显著或极显著上调,CCL4、HMOX1、NR4A2基因表达量显著或极显著下调,推测EGFR基因可以通过调控颗粒细胞中相关基因及信号通路的表达,进而调控卵泡的发育。本研究为分析EGFR基因对卵泡发育的调控机制提供了理论参考依据。

关 键 词：EGFR基因 转录组测序 蛋鸡 颗粒细胞 差异表达基因 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]