绵羊COL6A1基因克隆、表达特征及其与泌乳性状的关联性研究  

作　　者：李璐 刘圆 王自科 王元生 车陇杰 王继卿[1] 郝志云 

机构地区：[1]甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃兰州730070 [2]甘肃省畜牧技术推广总站,甘肃兰州730030 [3]兰州市副食品基地建设中心,甘肃兰州730010

出　　处：《中国畜牧杂志》2025年第1期256-262,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：甘肃农业大学公招博士科研启动项目(GAU-KYQD-2021-05);甘肃省重点研发计划项目(23YFNA0009);兰州市科技计划项目(2022-2-91)。

摘　　要：VI型胶原蛋白α1链(Collagen Type VI Alpha 1 Chain,COL6A1)是胶原蛋白家族中的一个亚型,对乳腺细胞外基质的结构和功能具有重要作用,然而目前尚无绵羊COL6A1基因的核苷酸序列变异特征及其对泌乳性状影响的研究。本研究采用逆转录PCR(Reverse Transcription PCR,RT-PCR)、实时荧光定量PCR(Real Time Quantitative PCR,RT-q PCR)、竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele-Specific PCR,KASP)和生物信息学方法,克隆绵羊COL6A1基因的完整CDS区,检测其在不同组织中的表达量,并对重要SNPs进行分型,最后分析该基因核苷酸序列变异对绵羊泌乳性状的影响。绵羊COL6A1基因CDS区全长为3084 bp,编码1027个氨基酸。RT-q PCR结果表明,COL6A1基因呈现出组织特异性表达,它在乳腺组织中的表达量最高,而在肝脏中的表达量最低。COL6A1蛋白质的二级结构主要以无规则卷曲为主。KEGG分析结果表明,COL6A1基因主要注释到PI3K-Akt、ECM受体交互、细胞黏附、蛋白质消化和吸收等信号通路中。String分析结果表明,COL6A1可与COL5A1、COL3A1及整合素亚基α1(Integrin Alpha 1,ITGA1)、整合素亚基α11(Integrin Alpha 1,ITGA11)和整合素亚基β5(Integrin Beta 5,ITGB5)等蛋白交互发挥作用。应用Sanger测序和KASP分型技术,在绵羊COL6A1基因第35外显子区域发现1处c.2850G>A的同义突变,由AA、GG和AG 3种基因型构成。相关性分析结果表明,GG基因型个体的乳蛋白率较AA型个体提高了0.14%(P<0.05),而AG型个体的乳脂率较AA型个体提高了0.25%(P<0.05)。该结果为深入研究COL6A1基因对绵羊泌乳性能的生物学影响提供了基础数据。

关 键 词：COL6A1基因 核苷酸变异 组织表达 泌乳性状 

分 类 号：S826.2[农业科学—畜牧学]