毛果杨SRS基因家族生物信息学分析  

ioinformatics Analysis of the SRS Gene Family in Populus trichocarpa

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作  者:张煜滔 郝爱平[1] 张佳玉 李想 薄琳 ZHANG Yutao;HAO Aiping;ZHANG Jiayu;LI Xiang;BO Lin(Mudanjiang Normal University,College of Life Science and Technology,Mudanjiang 157011,China)

机构地区:[1]牡丹江师范学院生命科学与技术学院,黑龙江牡丹江157011

出  处:《牡丹江师范学院学报(自然科学版)》2025年第1期41-47,共7页Journal of Mudanjiang Normal University:Natural Sciences Edition

基  金:黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(1451ZD004);牡丹江师范学院研究生科技创新项目(kjcx2023-103mdjnu)。

摘  要:探索毛果杨SRS基因家族的结构功能.利用生物信息学方法分析毛果杨SRS基因家族蛋白理化性质、启动子顺式作用元件、基因结构与保守序列.研究结果表明,PtSRS基因家族成员4个分支(A1~A4),所有成员均含有内含子及外显子;9条染色体中定位有PtSRS基因;大部分成员预测到防御、应激反应顺式作用元件(TC-richrepeats)以及脱落酸响应元件(ABRE).PtSRS基因家族在毛果杨的激素调控和抗逆反应方面发挥着重要作用.The structural and functional exploration of the Populus trichocarpa SRS gene family was conducted.Using bioinformatics approaches,the physicochemical properties of the PtsSRS family proteins,promoter cis-regulatory elements,gene structure,and conserved sequences were analyzed.The results indicated that the PtSRS gene family consists of four branches(A1~A4),with all members containing both introns and exons.The genes were mapped to nine chromosomes in the Populus trichocarpa genome.Additionally,most of the members were predicted to contain cis-regulatory elements related to defense and stress responses,such as TC-rich repeats and ABA-responsive elements(ABRE).The PtSRS gene family plays a crucial role in hormone regulation and stress response in Populus trichocarpa.

关 键 词:毛果杨 SRS基因家族 生物信息学分析 

分 类 号:Q78[生物学—分子生物学]

 

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