基于基因组的生菜软腐病原鉴定与遗传变异分析  

作　　者：林智 张静静 张硕 安帅霖 王金辉 陈雪蛟 

机构地区：[1]河北农业大学植物保护学院,河北保定071066

出　　处：《中南农业科技》2025年第1期14-19,共6页South-Central Agricultural Science and Technology

基　　金：河北农业大学校级创新训练项目(2023030)。

摘　　要：为分析2022年云南省昆明市温室生菜软腐病,对从生菜软腐病株中分离的2株极地果胶杆菌(Pectobacterium polaris)CM22112和CM22123进行了高通量测序。通过16S rDNA序列分析和生理生化代谢分析,确认了CM22112、CM22132菌株与极地果胶杆菌菌株NIBIO1006^(T)联系较近,并进一步确定为极地果胶杆菌。通过全基因组测序技术,得到CM22112和CM22132基因组序列长度分别为5 223 707 bp和5 043 792 bp,GC含量分别为54.16%和52.11%,并对测序结果进行了注释与致病系统分析。对极地果胶杆菌种内28个菌株进行比较基因组分析揭示了种内的基因组变异,为制定具有针对性的病害防治方案提供理论支撑,也为揭示果胶杆菌的遗传进化机制提供理论基础。

关 键 词：极地果胶杆菌(Pectobacterium polaris) 生菜软腐病 全基因组测序 病原鉴定 遗传变异 

分 类 号：S436.341.13[农业科学—农业昆虫与害虫防治] Q939.1[农业科学—植物保护]